牡丹江市的名字来源于黑龙江省东南部的一条河流—牡丹江。
牡丹江,满语称“穆丹乌拉”(意为“弯曲的江”),是黑龙江省东南部的一条河流,位于黑龙江省东南部,是松花江最大支流,发源于完达山脉张广才岭西侧,自西北向东南斜贯中部,流经海林、宁安两县,在宁安县镜泊湖出镜泊湖,继续东南流至东京城,与倭肯河汇合后称为绥芬河,折向南流入俄罗斯境内,注入日本海。全长1120公里,流域面积138万平方公里,其中中国境内流域面积130.4万平方公里,约占全流域总面积的93%;干流河道长793公里,平均比降0.94‰。年径流量210亿立方米。